核酸自动提取仪有哪些分类?影响核酸提取的因素有哪些?
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以下内容中,小编将对核酸自动提取仪的相关内容进行着重介绍和阐述,希望本文能帮您增进对核酸自动提取仪的了解,和小编一起来看看吧。
一、核酸自动提取仪及其分类
核酸自动提取仪又名核酸自动纯化仪,是应用配套的核酸提取试剂,来自动完成样本核酸提取工作的仪器。广泛应用在疾病控制中心、临床疾病诊断、输血安全、法医学鉴定、环境微生物检测、食品安全检测、畜牧业和分子生物学研究等多种领域。
1.根据仪器型号大小不同划分
自动液体工作站:自动液体工作站是功能非常强大的设备,液体分液、吸液等自动完成,甚至能通过整合扩增、检测等功能,实现标本提取、扩增、检测全自动化。大型自动液体工作站因为设备成本高昂,运行成本高,适合一次提取几千个同一种类标本,所以真正得到应用的比较少。
小型自动核酸提取仪:利用封装好的配套试剂自动完成提取纯化过程;小型自动化的仪器,因为仪器设备和运行成本低,操作方便得到越来越多的应用。
2.根据提取原理不同划分
离心柱法的仪器:离心柱法核酸提取仪主要采用离心机和自动移液装置相结合的方法,通量一般在1-12个样本,操作时间和手工提取相差无几,不能提高实际工作效率,且价格昂贵,不同型号仪器的耗材也不能通用。
磁珠法的仪器:以磁珠为载体,利用磁珠在高盐低PH值下吸附核酸,在低盐高PH值下与核酸分离的原理,再通过移动磁珠或转移液体来实现核酸的整个提取纯化过程。由于其原理的独特性,所以可设计成很多种通量,既可以单管提取,也可以提取8-96个样本,且其操作简单快捷,提取96个样本仅需30-45min,大大提高了实验效率,且成本低廉,是目前市场上的主流仪器。
二、影响核酸提取效率的因素
一般核酸提取的主要步骤分为四步:裂解、吸附、洗涤和洗脱,每一步出现问题都会影响磁珠的提取效率。下面就具体介绍一下影响核酸提取效率的一些因素。
1、样本裂解是裂解细胞或病原体,释放里面的核酸。影响裂解的主要因素有裂解液的成分及裂解的温度和时间。
裂解液成分:对于一些难裂解的样本,可以通过提高胍盐浓度以及表面活性剂浓度来增强裂解液的裂解能力。
裂解温度和时间:提高温度和增加裂解时间可以让细胞裂解更彻底,得到更多核酸,需要摸索合适的温度和时间;温度过高或时间过长,也有可能导致核酸断裂或醇类挥发导致的提取效率下降。
2、吸附是磁珠吸附核酸的能力,影响吸附能力的有磁珠的吸附能力以及结合缓冲液的结合能力。磁珠吸附能力受到磁珠比表面积以及修饰基团的密度影响。可根据实际样本选择磁珠粒径和修饰基团。
自动核酸提取仪
3、洗涤是去除DNA以外的RNA、蛋白质等杂质。关系到核酸的纯度,磁棒的振荡幅度和混合时间会影响洗涤效率。磁棒振荡幅度太小或混合时间太短,有杂质残留在磁珠上会影响磁珠吸附核酸的能力。振荡太剧烈或时间太长,会丢失部分核酸或造成核酸的断裂、降解,得率下降。
4、 洗脱是解离吸附在磁珠上的DNA,得到纯度和浓度均很高的DNA,直接影响核酸得率,影响洗脱效率的因素有磁珠的干燥程度以及洗脱温度和时间。磁珠未充分晾干,可能会有醇类等杂质残留,影响后续 PCR 反应;磁珠过分干燥,核酸可能会干结在磁珠上,导致洗脱效率下降。适当提高洗脱温度和时间,有利于核酸从磁珠上游离下来,时间过长或温度过高,核酸有可能会降解,需要把握其中的平衡。
全自动核酸提取仪能够实现自动化、高通量操作,适用于疾病控制中心、临床疾病诊断、输血、出入境检验检疫、食药监、法医学鉴定、环境微生物检测、食品检测、教学、科研、畜牧业和分子生物学研究等多种领域,尤其是对各地区爆发疫情需大规模核酸检测起着至关重要的作用。
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