百奥智汇:致力挖掘单细胞大数据助力疾病诊疗
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近年来,随着测序技术的迅猛发展,单细胞测序技术已逐渐走入人们视野。2013年,单细胞测序技术成为《自然》评选的“Method of the Year”。大多数的基于NGS的基因检测,都是在大量细胞宏观水平上,对整个细胞群进行遗传分析。单细胞测序技术则是在单个细胞的水平上,对其遗传物质进行检测,从而从更精细的水平观察突变如何协同作用来驱动疾病。因而,相较于常规的基因检测,单细胞测序可以获得更为庞大的细胞遗传信息。
但在单细胞测序领域,如何对这些庞大的细胞遗传信息进行分析仍是一大难题。以免疫细胞T细胞为例,单细胞测序技术可以发现T细胞亚群、不同的T细胞状态、不同细胞亚群的异质性及其潜在效用。这些细胞信息都需要通过生物信息学工具进行分析、整合,才能充分发挥单细胞测序的优势,对庞杂的细胞遗传信息进行更深入的了解。
百奥智汇致力于单细胞测序技术和生物信息技术研究,通过与医院、科研机构以及制药公司合作,挖掘单细胞基因组学和生物信息学在人类疾病诊断和治疗上的应用。
“生物信息学+单细胞测序”赋能疾病诊疗
百奥智汇成立于2018年,创始人张泽民博士曾任罗氏生物信息部门首席科学家,在生物信息领域有着20多年的沉淀,同时他也是国际知名的肿瘤基因组学专家,拥有超过60多项美国专利和多项欧洲专利。
公司的核心团队成员拥有基因组学、生物信息学、ICT以及投资等专业背景。此外,公司拥有中科院院士、北大终身教授在内的科学顾问委员会为公司研究提供支持。委员会成员包括中国理论生物学、生物信息学和非编码RNA研究的先驱学者陈润生院士,陈院士曾参与人类基因组1%和水稻基因组工作草图的研究。
单细胞测序技术应用广泛,对疾病诊断和治疗、临床试验乃至临床前试验都具有重要意义。例如,医院往往具有珍贵临床样本,单细胞测序技术可以对这些样本进行更深入的数据挖掘和分析,为疾病诊断、治疗提供指导。以肿瘤为例,传统的肿瘤基因研究往往把特定部位的肿瘤当做一个单一的组织,从而寻找疾病相关的基因突变,或者基因表达量的变化。而利用单细胞测序技术可以实现对肿瘤更深层次的理解,甚至超越现有人们对肿瘤研究的认知。
对于单细胞测序研究以及生物信息学分析,张泽民博士颇有心得。“肿瘤的组织不是单一的,而是内部结构极为复杂的混合体,在这个混合体中可能只有一些微量的个体细胞发生病变。”张泽民博士解释道,“肿瘤微环境中具有异质性的各种肿瘤细胞和免疫细胞,这些少量或者单个的细胞的病变从肿瘤组织层面来看是微小的,很可能被湮没在大量其他细胞中,但在单细胞层面可能是巨大的变化。”