德国科学家利用超级计算机辅助治疗癌症
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一直以来,肿瘤学家们都希望,根据对组织切片的分析,预测一个肿瘤朝哪个方向发生突变,以便对症下药进行治疗。
德国柏林沙利特医院分子肿瘤病理学实验室利用波茨坦大学哈索-普拉特纳研究所(HPI) 5月14号正式投入运行的新型超级计算机进行癌症病人基因组测序,进行基因分析,针对病人量体裁衣建立治疗模型。这一超级计算机拥有1500个平行计算的CPU,内存30太字节(1012),外存200太字节。与常规的系统不同,待处理的数据不是放在硬盘上,而是在计算过程中全部放在内存上。这台超级计算机有2太字节的内存专门用于存放数据,因此可采用全新的内存数据库技术(In-Memory),使得数据处理速度提高了一千倍,这种类型的计算机目前世界上才只有三台。以往,沙利特医院分子肿瘤病理学实验室委托院外企业做病人基因组测序,公司保证在90天内提交结果。用这台计算机,在未来作基因分析几分钟也许甚至几秒钟就可完成。这样就可大大缩短从做出诊断到开始治疗的时间,一旦做出诊断,紧跟着就能制定出治疗方案,从而也大大减少了肿瘤发生变化对疗效的影响,使治疗方案更精准。
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